「価値の低い広告枠(コンテンツのないサイト)について」
この指摘のとおりコンテンツがないページ(例えば404ページ)にも、サイドバーにアドセンスが表示されているためだと思います。
ポリシー違反にならないための1番手っ取り早い方法が、サイドバーにアドセンスを設置しないことです。
また、条件分岐でコンテンツがある投稿ページのみに、サイドバーにアドセンスを表示するといいかもしれません。
ただ、条件分岐のためにはテンプレートを変更するか、プラグインを厳選し使用する必要があります。
eval() が使われている Widget Logic などは、むやみに使用しては危険です。(一応 Widget Logic はeval() の回避方法は用意されています。)