いつもこちらのテーマにはお世話になっております。
不具合というには微妙なので、間違っていたらごめんなさい。
simplicity1.8.9で発生しています。
記事下の広告はad-article-footer.phpで制御されていると思いますが、
カスタマイズで完全レスポンシブルにチェックすると、ad-article-footer.phpの
内容に関わらず記事下の広告が1つだけ表示されるようです。
内容に関わらずと書いたのは、完全レスポンシブルにしたあと広告が1つだけしか
表示されなくて変だなと思ってad-article-footer.phpの広告表示処理を
全部削除してみたのですが、それでも広告が1つだけ表示されたためです。
完全レスポンシブルのチェックを外すと正しくad-article-footer.phpの
ファイルを読んで処理をしているようでしたので、今はチェックを外して運用しています。
内部処理を把握している訳ではないため私の勘違いかもしれませんが、
もし、意図している処理と異なっていたらと思いまして。