></body>タグの前に設置することが可能でしょうか?
これは、どんなスクリプトを利用されるかわからないので確定ではないのですが、単純にphpスクリプトであれば、footer-insert.phpに書き込めば</body>前で読み込まれると思います。
analytics.phpはfooter-insert.phpの手前で読み込まれる(footer.php参照)ので同じことなんですけども、わかりやすく、機能を分けて書いておきたいと言う場合は、analytics.phpの「//以下その他の解析コードなど」の中に書けば、ログインしていないユーザー、つまりは一般の人のアクセスを解析できると思います。
わいひらさんのコメント曰く
//アクセス解析コードを挿入するにはanalytics.phpへの挿入を推奨
とあるので、analytics.phpの方が良いですかね。
ヘッダに既にあるjavascriptを/body手前で読み込ませるのはひと工夫要りますが、元々自分で貼り付けるタイプのスクリプトなら上記と同様にすればできるのではないかと思うんですけれども、どうでしょう?
そのアクセス解析をしたいスクリプトがヘッダにないと動作しないとか、あるいはasync defer等がつけられないjavascriptの場合は別途何かしらのスクリプト(か、プラグイン)で読み込ませる感じになると思います。